El segundo chakra se denomina Swadhisthana, corresponde al Propio Lugar de Uno y se encarga de controlar el océano de fluidos que se encuentran en el cuerpo humano.

Los fluidos son aquellos como la sangre, la bilis, el fluido linfático, la transpiración, la orina, la saliva, la leche materna, las secreciones vaginales que se dan durante la relación sexual, y las secreciones lubricantes de las glándulas conductoras de los genitales tanto masculinos como femeninos.

Este chakra encierra la máxima védica "Como es arriba es abajo". Esto se interpreta según el Tantra como la exudación que ocurre durante la estimulación sexual en los capilares de las paredes vaginales, al igual que un fluido cerebral espinal es constantemente secretado por los capilares de las cavidades de los ventrículos cerebrales.

En este chakra se ve un cocodrilo que está exhalando fuego, el cual es una bestia mítica conocida como Makara, y es el vehículo de Varuna, señor de las aguas cósmicas. También es la montura de la diosa Ganga.

Este cocodrilo aparece en la bandera de Kama, el Cupido de la India. Es por eso que por mucho tiempo, e incluso hoy en día, se consumen ritualmente los genitales de este animal como afrodisíacos.

El ciclo menstrual se encuentra siempre ligado a los ciclos lunares, pues ambos cumplen sus fases en un término de veintiocho días. En Swadhisthana se ve la media luna deteniendo la letra sánscrita del sonido Vam que se pronuncia wum y que es el mantra asociado a la vibración del agua.

En la cifra sánscrita se encuentran acurrucados el Dios y la Diosa, separados por el pilar dorado del camino medio denominado Shushumna o "sendero real".

El dios Vishnu quien es el preservador de la vida, y que desde el punto de vista biológico mantiene la homeostasis de los fluidos del cuerpo, se encuentra a la izquierda en Swadhisthana.